Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sp4Q62445 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms