Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sh3gl2Q62420 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Sh3gl2Q62420 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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Sh3gl2Q62420 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Sh3gl2Q62420 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Sh3gl2Q62420 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Sh3gl2Q62420 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Sh3gl2Q62420 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Sh3gl2Q62420 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Sh3gl2Q62420 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Sh3gl2Q62420 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms