Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpaQ62189 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpaQ62189 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpaQ62189 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpaQ62189 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpaQ62189 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpaQ62189 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpaQ62189 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpaQ62189 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpaQ62189 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpaQ62189 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpaQ62189 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpaQ62189 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpaQ62189 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpaQ62189 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms