Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema3cQ62181 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema3cQ62181 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema3cQ62181 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema3cQ62181 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema3cQ62181 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema3cQ62181 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms