Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms