Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd1Q62101 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms