Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga6Q61739 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga6Q61739 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms