Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms