Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms