Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PcolceQ61398 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PcolceQ61398 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PcolceQ61398 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PcolceQ61398 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PcolceQ61398 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PcolceQ61398 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PcolceQ61398 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PcolceQ61398 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PcolceQ61398 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PcolceQ61398 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PcolceQ61398 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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