Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms