Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd2Q61285 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd2Q61285 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd2Q61285 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd2Q61285 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd2Q61285 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd2Q61285 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd2Q61285 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd2Q61285 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd2Q61285 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd2Q61285 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd2Q61285 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd2Q61285 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd2Q61285 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd2Q61285 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd2Q61285 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd2Q61285 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd2Q61285 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd2Q61285 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms