Protein–RNA interactions for Protein: Q61235

Sntb2, Beta-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntb2Q61235 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sntb2Q61235 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sntb2Q61235 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms