Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Cln3Q61124 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Cln3Q61124 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Cln3Q61124 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cln3Q61124 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Cln3Q61124 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln3Q61124 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms