Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JrkQ60976 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JrkQ60976 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JrkQ60976 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JrkQ60976 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JrkQ60976 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms