Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik1Q60934 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms