Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms