Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms