Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms