Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms