Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SkiQ60698 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SkiQ60698 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SkiQ60698 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SkiQ60698 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms