Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxd4Q60688 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms