Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgaeQ60677 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgaeQ60677 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgaeQ60677 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms