Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms