Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CttnQ60598 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CttnQ60598 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CttnQ60598 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CttnQ60598 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CttnQ60598 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms