Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Thoc6Q5U4D9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thoc6Q5U4D9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms