Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms