Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms