Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ankrd40Q5SUE8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms