Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trav6-2Q5R1I4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trav6-2Q5R1I4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms