Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms