Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trim41Q5NCC3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms