Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CoblQ5NBX1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CoblQ5NBX1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms