Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms