Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps41Q5KU39 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms