Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms