Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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