Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms