Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms