Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms