Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms