Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms