Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Trp53i11Q4QQM4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trp53i11Q4QQM4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trp53i11Q4QQM4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trp53i11Q4QQM4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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Trp53i11Q4QQM4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trp53i11Q4QQM4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trp53i11Q4QQM4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trp53i11Q4QQM4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53i11Q4QQM4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Trp53i11Q4QQM4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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