Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a5Q4LDG0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms