Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms