Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9Q3V038 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ttc9Q3V038 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9Q3V038 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9Q3V038 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9Q3V038 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9Q3V038 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9Q3V038 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9Q3V038 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9Q3V038 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9Q3V038 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9Q3V038 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9Q3V038 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9Q3V038 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9Q3V038 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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