Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms