Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim40Q3UWA4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms