Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn13Q3UW68 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms