Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms